[浙江]西湖大学应急医学研究中心孙开元实验室（多尺度宿主病原动力学实验室）

职位：博士后
发布时间：2025-04-30
工作地点：其它
信息来源：西湖大学
职位类型：全职
专业标签：生物科学
职位描述
西湖大学应急医学研究中心孙开元实验室（多尺度宿主病原动力学实验室）博士后招聘启事

类别：博士后

地点：应急医学研究中心

就业类型：全职

一、?实验室简介

????PI简介

????孙开元博士于2018年获得美国东北大学物理学博士学位，师从复杂系统与传染病建模交叉领域的Alessandro Vespignani教授，博士期间专注于多尺度复杂系统理论及其在传染病动力学中的应用。博士毕业后，在美国国立卫生研究院福格提国际中心（Fogarty International Center）担任博士后（导师：Cécile Viboud）及研究科学家，系统开展呼吸道病毒（包括流感病毒、SARS-CoV-2和RSV）的传播动力学、免疫保护机制、跨尺度传播建模与疫情防控策略研究。其代表性成果发表于《Science》《Nature Medicine》《Science Translational Medicine》《The Lancet Digital Health》等期刊。孙开元博士计划于2026年2月加入西湖大学应急医学中心，任研究员、助理教授，并兼聘于西湖大学交叉科学中心。

????实验室方向

????多尺度宿主-病原动力学实验室致力于利用数学与计算模型，系统揭示感染性疾病，特别是呼吸道病毒的跨尺度传播与免疫机制，搭建从分子、个体到人群层面的系统建模框架。实验室结合数理建模、流行病学、生物信息学与免疫学的方法，探索病毒进化、免疫保护与疾病传播之间的动态关系。

????核心研究方向包括：

????·?呼吸道病毒免疫保护指标（Correlates of Protection, CoPs）建模：?结合血清学、流行病学与临床数据，识别感染与传播防护相关的免疫标志物，助力疫苗设计与评估。系统探索免疫记忆、抗原进化与免疫印记等复杂免疫现象的动力学规律，为新一代疫苗开发提供理论支撑与方法依据。

????·?跨尺度感染、免疫与传播动力学机制研究：构建多尺度数学与计算模型，连接个体内病毒复制与免疫应答过程至人群层面的传播与演化动力学，解析病原体适应性演变、抗原漂移与免疫印记等关键过程。

????·?疫情干预策略的建模与人工智能交叉研究：基于高质量流行病学与行为学数据，构建数据驱动的动态建模平台，系统量化疫苗接种、非药物干预、个体反应性行为（reactive behavior）等多因素对疫情传播动态的多尺度影响。进一步，融合博弈论与多智能体强化学习方法，创新探索疫情响应策略的智能模拟与自适应优化，突破传统建模与决策体系的局限，显著提升传染病预测、干预设计与资源配置的智能化水平，为公共卫生政策制定提供更具前瞻性、科学性与适应性的决策支持。

????·?蛋白质语言模型在基因组流行病学与毒株预测中的应用：应用蛋白质语言模型与分子进化分析方法，预测病毒适应性变异，促进分子演化机制与宏观传播动力学模型的融合，提升对病毒传播与演化趋势的前瞻性理解。

????·?传染病大流行预警与预测平台开发：集成流行病学监测数据、病原体基因组数据与人群行为数据，开发动态风险评估与趋势预测系统，实现对潜在大流行病原的早期识别、传播动态监测及智能预警，支撑全球健康安全与应急响应体系建设。

二、招聘岗位及条件

1.招聘岗位：博士后（2-3名）

2.任职条件：

（1）独立开展课题研究；

（2）协助培养实验室学生及科研助理；

（3）撰写研究论文、综述；

（4）参与基金项目申请以及学术交流。

3.要求：

（1）年龄不超过35周岁；已取得或即将取得博士学位；

（2）需符合以下至少一个方向：

方向1（基因组流行病学）：

具有生物信息学、基因组学、流行病学、微生物学、计算生物学等相关学科的研究背景。熟练掌握BEAST、Nextstrain、IQ-TREE等主流分析工具，熟悉病毒序列数据库（如GISAID、NCBI SRA、CNGB等）。

具有以下研究兴趣者将优先考虑：

1）利用蛋白质语言模型进行病毒进化路径预测；

2）探索将分子流行病学与传染病动力学模型融合的方法，以推动对病毒传播和演化机制的深入理解。

方向2（理论/计算免疫学）：

具有理论物理、应用数学、计算生物学或相关学科背景的博士后研究员。需具备定量生物学建模的研究经验，能够运用数学模型和计算方法开展免疫系统相关机制的探索。

我们优先考虑对以下研究方向感兴趣的申请者：

1）利用理论建模揭示机体针对病原体的免疫应答规律；

2）构建和分析跨尺度的免疫动力学模型，以理解免疫记忆、免疫印迹或群体免疫建立过程中的关键机制。

欢迎具备扎实数理基础、对生物系统建模充满热情、并愿意在交叉学科环境中开展开创性研究的博士加入团队。

三、薪酬待遇

1.根据个人科研工作能力提供具有市场竞争力的薪酬，具体面议。实验室将提供稳定的工作环境与一流的研究平台，协助申报博士后相关项目等。

2.学校可协助办理落户、协助对接子女的入学入托服务工作。

3.学校提供全方位培养体系，设立“西湖大学优秀博士后”“西湖优秀女性博士后奖”等项目。

四、资助政策

1.博士后可享受杭州市在站博士后资助政策。

2.对获得中国博士后科学基金资助和浙江省博士后择优项目资助的，杭州市给予1:1配套资助。

3.对出站留杭（来杭）工作的博士后，杭州市给予每人40万元补助。

4.对来杭工作符合条件的全球本科及以上学历应届毕业生（含毕业5年内的回国留学人员、外国人才），杭州市发放生活补贴，其中博士10万元。

5.可申请认定杭州市高层次人才，并享受相应政策。

五、应聘方式

请将以下材料以PDF形式发送至sunkaiyuan@邮箱，邮件标题请注明：“应聘博士后+本人姓名”，对于符合要求并通过初审者，将会通知安排面试。招聘启事在岗位招满前有效。

1.个人简历；

2.2位同行专家的推荐信；

3.博士学历学位证明材料。